Hvornår Metroid Prime: Federation Force blev afsløret, det blev mødt med så meget tilbageslag. Mange spillere havde aldrig set så meget vitriol og hader rettet mod et spil med øjeblikke om at det blev annonceret. Men der var altid chancen for Nintendo at vinde dem over - trods alt, hvis spillet faktisk var godt, ville folk købe det da, ikke? Nå ligner det i dette tilfælde, Metroid fans virkelig talte med deres tegnebøger denne gang, i hvert fald i Japan.
Ifølge Famitsu solgte 3DS FPS kun 4286 eksemplarer inden for sin første uge, helt efterfølgende som efter Ingen Menneskehimmel (som solgte 15.977 enheder) og King of Fighters XIV (som solgte 23.242 enheder).
Og hvis du synes det er dårligt, i Det Forenede Kongerige, brød det ikke engang ind i all-format software charts, der kommer under meget ældre titler som Nye Super Mario Bros 2 og Tomodachi Life. Nogle afsætningsmuligheder skriver allerede titlen som en flop.
Anmeldelser har i mellemtiden været gennemsnitlige i bedste fald. På Metacritic har den en gennemsnitlig score på 65/100.
Hvorvidt alt dette vil medføre, at Nintendo tager Metroid serier tilbage til sine rødder eller bare dumper serien i samme hul, de sætter F-Zero og Earthbound i tilbage for at blive set.